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我院王少璞副研究员首次构建大型婴幼儿肠道菌群基因组和基因参考目录


     近日,四川大学华西第二医院王少璞副研究员在国际期刊《Nature Communications》(IF=17.69)发表了题为“A compendium of 32,277 metagenome-assembled genomes and over 80 million genes from the early-life human gut microbiome”的最新研究成果,构建了目前国际上最大的婴幼儿肠道菌群基因组和基因参考目录,对后续的婴幼儿肠道菌群研究提供重要的参考意义,为更全面的了解婴幼儿肠道菌群发育及与疾病的关系奠定了基础。该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金等资助。



研究团队通过分析6122个婴幼儿的肠道菌群宏基因组测序数据,构建了32277个婴幼儿肠道菌群基因组和4036936非冗余蛋白序列,建立了目前已知最大的婴幼儿肠道菌群基因组参考目录(ELGG)和蛋白参考目录(ELGP)。在菌种水平,该基因组目录共包含2172个菌种,包括2171细菌和1个古生菌,其中60%的菌种在体外目前无法通过培养获得,扩展了婴幼儿肠道菌群多样性。


王少璞副研究员是四川大学引进的优秀科研人才,硕士生导师,苏黎世联邦理工学院(ETH Zurich)博士,爱尔兰国家肠道微生物研究中心(APC Microbiome Ireland)和爱尔兰农业部食品研究中心(Teagasc)博士后。研究方向主要为母婴肠道菌群与新生儿疾病。目前以第一作者/通讯作者在Nature CommunicationsGut MicrobesTrends in GeneticsTrends in MicrobiologyFEMS Microbiology Reviews, Carbohydrate Polymers等期刊发表多篇论文。

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-022-32805-z


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