四川大学华西第二医院西部妇幼医学研究院（以下简称研究院）始建于2007年，依托于医院的统筹管理，实行“开放、流动、协作、竞争”的运行机制与研究院院长负责制，院长为刘瀚旻教授。

研究院现有实验空间19000余平方米，其中华西院区约10000余平方米，前沿医学中心约9000余平方米，宽敞明亮、设施一流。拥有科研仪器设备共享平台、实验动物中心、生物样本库三大支撑平台，集聚了诸如小动物专用MRI、辐照仪、激光共聚焦显微镜、活细胞成像系统、流式细胞仪、斑马鱼行为学分析系统等上亿的科研仪器设备。

以创建全国妇幼医学领域一流的、集科学研究、人才培养和成果转化为一体的科研教学平台为目标定位，研究院按照医院整体研究规划和发展目标，建有生物治疗全国重点实验室、出生缺陷与相关妇儿疾病教育部重点实验室、时间生物学国家卫生健康委员会重点实验室、发育与妇儿疾病四川省重点实验室、儿童药物四川省重点实验室及四川省妇幼健康国际联合研究中心；根据妇儿重点研究方向设有基础与临床相结合的独立或联合研究平台（中心）与实验室，实行主任、PI负责制；坚持协同创新，组建学科交叉融合的科技创新平台与团队，培养专职科研人员两百余人。

研究院软硬件相得益彰，以支撑医院一流学科发展、以服务四川大学世界一流大学建设为使命，瞄准妇幼医学国际前沿领域，立足科研发展与人才培育，实现国际化、高水平与可持续发展。