根据四川大学《关于同意成立四川大学华西儿童医学中心的批复》（川大医[2012]1号）文件精神，四川大学华西儿童医学中心于2012年3月1日在四川大学批准下成立，在四川大学华西医院和四川大学华西第二医院分别挂牌，中心主任由四川大学华西第二医院常务副院长母得志教授担任，中心副主任分别由华西医院向波教授、华西第二医院万朝敏教授担任。

华西儿童医学中心按照学校管理及学科发展要求，主要负责统筹规划和协调实施儿科学科建设，加强儿科学学科建设与管理，加快人才梯队建设与培养，严格按照《医疗机构管理条例》要求开展学科诊疗工作，逐步提高科学研究和医疗诊疗水平，从医疗实际出发，深入探索以患儿为中心的服务模式，并在华西第二医院设置儿外科、眼科等相关学科诊室，建立院间病人转诊绿色通道，为儿童患者提供更加便利的就诊服务。